針對(duì)新型冠狀病毒的AI診斷技術(shù)，將在浙江大規(guī)模應(yīng)用！2月1日，浙江省疾控中心上線自動(dòng)化的全基因組檢測(cè)分析平臺(tái)。利用阿里達(dá)摩院研發(fā)的AI算法，可將原來數(shù)小時(shí)的疑似病例基因分析縮短至半小時(shí)，大幅縮短確診時(shí)間，并能精準(zhǔn)檢測(cè)出病毒的變異情況。
當(dāng)前，全國新型冠狀病毒肺炎疫情依然嚴(yán)峻，快速、精確診斷對(duì)于疫情控制尤其重要。公開信息顯示，該病毒是基因組序列最長的病毒之一，全基因組序列全長29847bp，臨床診斷需要將患者樣本與該病毒基因序列進(jìn)行比對(duì)才能確定診斷結(jié)果。
目前醫(yī)院普遍采用核酸檢測(cè)方法，其只能檢測(cè)到病毒基因的局部。由于病毒存在變異的可能性，對(duì)于整個(gè)基因序列來說這種檢測(cè)方法猶如盲人摸象，一旦病毒發(fā)生變異，就可能出現(xiàn)漏檢的情況。
浙江的全基因組檢測(cè)分析平臺(tái)由浙江省疾病預(yù)防控制中心、阿里達(dá)摩院醫(yī)療AI團(tuán)隊(duì)和杰毅生物技術(shù)公司共同研發(fā)。該平臺(tái)采用不同于核酸檢測(cè)方法的全基因組檢測(cè)技術(shù)，對(duì)疑似病例的病毒樣本進(jìn)行全基因組序列分析比對(duì)，能夠有效防止病毒變異產(chǎn)生的漏檢，并將原需數(shù)小時(shí)的全基因分析流程減少到半小時(shí)，大幅提高疑似病例的確診速度和準(zhǔn)確率。
疫情發(fā)生后，達(dá)摩院算法專家顧斐博士立即奔赴浙江省疾控中心，第一時(shí)間針對(duì)新型冠狀病毒基因進(jìn)行特征分析，并推出多個(gè)算法模型。在序列比對(duì)過程中，達(dá)摩院對(duì)算法增加了分布式設(shè)計(jì)，有效提升比對(duì)效率；在病毒序列拼接階段使用分布式設(shè)計(jì)的de Bruijn圖算法，變異病毒也能精準(zhǔn)檢測(cè)。
浙江省疾控中心基因測(cè)序負(fù)責(zé)人孫逸博士表示：“該平臺(tái)基于阿里云的強(qiáng)大算力與達(dá)摩院新算法可以為病毒的解析提供支撐，基于該平臺(tái)，未來還可以在短時(shí)間內(nèi)將檢測(cè)范圍覆蓋整個(gè)確診病例，也為后續(xù)疫苗與藥物研發(fā)打下了堅(jiān)實(shí)基礎(chǔ)。”
